Відразу після початку війни у Вовчанську почалась мобілізація воїнів у лави Червоної Армії. В перші дні війни на фронт пішло 552 добровольці, а всього з району на фронт пішло 25 тисяч чоловік. 

     Одразу перейшли на  випуск продукції для потреб армії підприємства Вовчанська. У вересні 1941 року з трудящих, які не підлягали мобілізації, було створено чотири партизанських  загони. Разом з військовими частинами вони брали участь в обороні міста.

      У листопаді 1941 року  фашистам вдалося на декілька днів захопити наше місто. Але частини Червоної Армії завдали ворогу відчутного удару, визволили від них місто і багато сіл району. 
      10 червня 1942 року  німецькі війська вдруге захопили Вовчанськ, завдавши місту і його жителям великих збитків.  Було зруйновано промислові підприємства, залізничну станцію, багато житлових будинків, пограбовані колгоспи і радгоспи, багато молоді вивезли до Німеччини. 
      10 лютого 1943 року вдруге і остаточно було визволено Вовчанськ від німецької окупації. 
     Мужньо билися жителі  Вовчанщини і на фронтах Великої Вітчизняної війни. Хто з нас не знає медсестри М.3. Щербаченко, яка при форсуванні Дніпра винесла з бою 112 поранених бійців. За цей подвиг вона удостоєна звання Героя Радянського Союзу. 
    Славетний бойовий шлях пройшли на Фронтах війни А.О. Кравченко з Білого Колодязя, Ф.К. Лисенко з Юрченкового, І.Ф. Погорєлов з Радянського, О.І. Помазунов з Верхнього Салтова, Ф.С. Сапельников з Караїчного, В.Т. Саєнко з Шевченкового Першого, Ф.В. Чайка з Чайківки, П.С. Шип з Червоноармійського Першого, В.І. Безмєнов з Бочкового, О.М. Голоско з Жовтневого Другого, які стали Героями Радянського Союзу. 
     Після визволення  району його жителі все робили для переможного завершення війни. Лише в 1943 році з квітня по червень до лав Червоної Армії влилося біля 10 тисяч жителів району.  За активної участі трудящих було обладнано приміщення для евакуаційного госпіталю № 5987, котрий прийняв перших поранених воїнів у серпні 1944 року. А всього на території району в період війни дислокувалось 46 госпіталів. Жителі району зібрали в фонд оборони 1,8 мільйона карбованців грішми, здали у фонд оборони  більш ніж на один мільйон карбованців облігацій  Державної воєнної позики. 
     Після вигнання німецько-фашистських загарбників з Вовчанська і району у діючу армію було мобілізоано ще біля 13 тисяч чоловік. 
    Не повернулися додому з фронтів другої світової війни 14 тисяч колишніх жителів району — солдатів і офіцерів. Понад 11 тисяч захисників Батьківщини полягло на територіїї району.